基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定与系统进化分析

Authors：冯震; 杨燕; 张宁; 蒋波; 李芳; 秦峰; 杨美成

Source：药物分析杂志, 2019, (11): 1940-1944.

DOI：10.16155/j.0254-1793.2019.11.03

• 伯克霍尔德菌
• 菌种鉴定
• DNA促旋酶亚基B(gyrB)基因
• DNA特征序列
• 系统发育分析 Burkholderia
• bacterial identification
• DNA gyrase subunit B(gyrB) gene
• DNA signature sequence
• phylogenetic analysis

目的:建立伯克霍尔德菌属典型菌株DNA促旋酶亚基B(gyrB)基因序列鉴定方法,为该菌属污染物的鉴定和分类提供研究思路和方法依据。方法:选择伯克霍尔德菌属内的典型菌株,以gyrB基因为研究靶点,设计引物,特异性扩增gyrB基因片段,测定核酸序列,并进行聚类比对分析。结果:伯克霍尔德菌属内的典型菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定。结论:本文建立了基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定方法,菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定,为该菌属污染物的鉴定与风险排查提供方法依据。