DNA条形码序列对9种蒿属药用植物的鉴定

Authors：LIU Mei zi SONG Jing yuan LUO Kun LIN Yu lin LIU Ping YAO Hui National Engineering Laboratory for Breeding of Endangered Medicinal Materials Institute of Medicinal Plant Development Chinese Academy of Medical Sciences; Peking Union Medical College Beijing China Tianjin University of Traditional Chinese Medicine Tianjin China

Source：中草药, 2012, (07): 1393-1397.

• 蒿属
• DNA条形码
• ITS2
• PCR扩增
• 遗传距离

目的采用DNA条形码序列对9种常见的蒿属药用植物进行鉴定,为常见蒿属药用植物的鉴定提供分子依据。方法对9种常见蒿属药用植物的4条候选DNA条形码序列(ITS2、rbcL、matK、psbA-trnH)进行PCR扩增和测序,比较各序列的扩增和测序效率,应用BLAST1、Distance方法来评估各序列的鉴定效率。此外,基于MEGA5分析9种常见蒿属药用植物ITS2序列种间K2P遗传距离并构建NJ树。结果除matK外,其余3条片段的PCR扩增和测序效率均为100%,ITS2序列对9种蒿属药用植物的物种水平鉴定成功率最高,为100%,而psbA-trnH、rbcL、matK、matK+rbcL的鉴定成功率(BLAST1法)分别为83.3%、66.7%、54.5%、75%。通过ITS2序列的种间K2P遗传距离及NJ树均能将不同物种全部区分。结论 ITS2序列可以作为鉴定蒿属药用植物的潜在条形码。

• Institution
  中国医学科学院北京协和医院; 北京协和医学院; 天津中医药大学