细粒棘球绦虫Calpain蛋白的生物信息学分析

作者：王芬; 陈林; 赵明才; 刘家瑞; 黎昆; 李龙; 胡容

来源：中国病原生物学杂志, 2019, (10): 1171-1177+1193.

DOI：10.13350/j.cjpb.191011

• 细粒棘球绦虫
• 钙蛋白酶
• 生物信息学
• 抗原表位 Echinococcus granulosus
• calpain
• bioinformatics
• epitope

目的采用生物信息学软件分析细粒棘球绦虫Calpain蛋白(EgCalpain)的结构与抗原表位,为研制基于Calpain的棘球蚴病疫苗提供依据。方法从NCBI核苷酸和蛋白质数据库下载EgCalpain的核苷酸和氨基酸序列,采用ProtParam、SignalP、TMHMM、Cell-Ploc等在线分析程序,结合DNAStar、DNAMAN等生物信息学软件分析、预测EgCalpain蛋白的理化性质、信号肽序列、跨膜结构域、亚细胞定位及抗原表位;采用Clustal omega程序对不同物种来源的Calpain蛋白进行多序列比对,并通过MEGA 6.06程序构建邻接树。结果 EgCalpain基因全...

• 单位
  重庆医科大学