乙肝病毒(HBV)感染对肝细胞癌(HCC)患者A-to-I RNA编辑的影响

作者：马婷; 黄海; 郝沛

来源：复旦学报(医学版), 2019, (06): 744-749.

• RNA编辑
• 乙肝病毒(HBV)
• 肝细胞癌(HCC)
• 腺苷酸脱氨酶(ADAR)
• 转录组 RNA editing
• hepatitis B virus(HBV)
• hepatocellular carcinoma(HCC)
• adenosine deaminases acting on RNA(ADAR)
• transcriptome

目的探究乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者肝脏正常组织和癌组织中腺嘌呤转变为次黄嘌呤(adenine to inosine,A-to-I)RNA编辑活性的影响。方法从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)收集28套成对正常组织和癌组织的转录组数据,分为HBV阴性正常组织(HBV-N)组、HBV阴性癌组织(HBV-T)组、HBV阳性正常组织(HBV+N)组和HBV阳性癌组织(HBV+T)组。用SPRINT软件进行位点鉴定后,从催化酶表达水平、位点编辑水平和位点所在基...

• 单位
  生命科学学院; 上海大学; 中国科学院上海巴斯德研究所