鼠疫耶尔森菌CAF-1基因的生物信息学分析及抗原表位预测

Authors：王姝懿; 赵学亮

Source：中国病原生物学杂志, 2019, (10): 1141-1146.

DOI：10.13350/j.cjpb.191006

• 鼠疫耶尔森菌
• CAF-1基因
• 抗原表位
• 生物信息学 Yersinia pestis
• CAF-1 gene
• antigen epitopes
• bioinformatics

目的探讨鼠疫耶尔森菌CAF-1基因的组成结构及生物学功能。方法运用ProtScale,TMHMM Server,Signal P 3.0 Server,NetPhos3.0 Server,SOPMA,Swiss-mode和DNAStar等生物信息学软件分析鼠疫耶尔森菌CAF-1基因的氨基酸序列组成、理化性质、亲疏水性、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点、二、三级结构和B、T细胞抗原表位等。结果 CAF-1是由170个氨基酸构成的富含苏氨酸的稳定亲水蛋白,相对分子质量为17.7×10~3,理论等电点为4.83,不含跨膜区且磷酸化程度较高。二级结构中β转角和无规则卷曲为主要结构原件,分别占41.18%...

• Institution
  西北农林科技大学