聚球藻Synechococcus sp.PCC 7336基因组结构解析

作者：李益; 饶妮妮; 刘汉明; 杨峰

来源：生物技术, 2014, 24(04): 46-51.

• 聚球藻
• 基因组
• 光合作用
• 信号传导
• 调控
• 进化

目的:对新测序菌株Synechococcus sp.PCC 7336的基因组结构分析。方法:利用多种生物信息学工具进行基本信息分析。构建本地比对数据库进行多序列比对分析。构建本地注释数据库进行基因、蛋白质功能分析。基于16S rRNA构建进化树对不同菌株进行聚类并分析进化差异。结果:GC含量为53.7%,共有5 096个蛋白质编码基因,47个RNA基因和不同类型的重复回文序列。与光合作用相关的基因分为9大类,信号传导以"双组分调控系统"为代表,11个次级代谢基因簇合成生物活性物质。进化分析显示其与传统聚球藻菌株差异较大,而与无类囊体蓝藻亲缘关系更密切。结论:Synechococcus sp.PCC 7336是聚球藻属中一个特殊的菌株,在基因组结构、基因数量、进化历程等方面都与其他菌株存在较大差异。