副溶血弧菌CalR蛋白结构与功能的生物信息学分析

作者：杨璐; 胡成进

来源：中国病原生物学杂志, 2019, (10): 1135-1140.

DOI：10.13350/j.cjpb.191005

• 副溶血弧菌
• VP0350
• CalR蛋白
• 生物信息学 Vibrio parahaemolyticus
• CalR protein
• bioinformatics

目的探讨副溶血弧菌VP0350基因编码蛋白CalR的结构和功能。方法从NCBI GenBank数据库中获取VP0350基因及其编码蛋白CalR序列;利用ExPASy服务器中的ProtParam及ProtScale预测CalR蛋白的一般理化性质及亲疏水性;利用TMHMM Server v.2.0及SignalP 4.0 Server分析CalR蛋白的跨膜区及信号肽;利用SOPMA分析CalR蛋白的二级结构并利用Phyre 2 sever对其进行蛋白质三级结构同源模型构建;利用NCBI的CDD(Conserved Domain Database)数据库,NetPhos 3.1Server及STRI...

• 单位
  潍坊医学院