协同创新在产业集群技术创新中占据重要地位。只有推动协同创新的持续发展,才能创造集群核心竞争力,促进集群转型升级。本文基于文献研究和对珠三角产业集群的案例研究,从组建投入机制、合作研发机制、决策管理机制三个方面梳理协同创新运行机制建设的现状,挖掘协同创新运行机制存在的4大问题,从政府引导、需求导向、持续投入、利益分配、风险分散、绩效考核6个方面构建基于可持续发展的协同创新运行机制系统,并提出具体化的对策建议。