中国幽门螺杆菌强细胞毒株和弱细胞毒株vacA基因全长序列特征与VacA活性的关系

摘要

目的:探讨中国幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)强细胞毒株和弱细胞毒株vacA基因序列差异对其VacA活性的影响.方法:从GenBank数据库下载4个强细胞毒株和4个弱细胞毒株vacA基因全长DNA和氨基酸序列,利用DNAMAN、lasergene 7.0、MEGA 5.03个生物信息学软件对其进行分析.结果:(1)中国H.pylori强细胞毒株、弱细胞毒株和西方强细胞毒株60190株3者之间在vacA基因序列上都存在明显的差异,这些差异主要集中在vacA基因p55结构域,表现为疏水性氨基酸与极性氨基酸之间的转换;(2)弱细胞毒株还存在多个插入变异位点;(3)强细胞毒株和弱细胞毒株,中国和西方分离株在系统发育树中分别聚类为不同的谱系.结论:vacA基因序列差异和插入突变可能是导致中国不同H.pylori VacA活性差异的重要原因.

关键词