番茄AT-hook基因家族的鉴定及胁迫条件下的表达分析

作者：丁丽雪; 李涛; 李植良; 徐小万; 李颖; 王恒明; 王永飞; 马三梅; 黎振兴

来源：植物遗传资源学报, 2016, (02): 303-315.

• 番茄
• AT-HOOK基因家族
• 生物信息学
• 基因表达
• 氧化胁迫 tomato
• AT-hook gene family
• bioinformatics
• gene expression
• oxidative stress

AT-hook蛋白家族在植物生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄AT-hook基因家族的成员、分布、结构和功能进行分析。结果表明,番茄AT-hook家族包含32个成员,分为3种类型,其中类型Ⅰ含有13个成员;遗传进化分析表明番茄AT-hook基因成员与拟南芥家族基因具有相似分类。利用实时荧光定量PCR对番茄32个基因开展组织表达分析,结果表明AT-hook基因具有表达差异,主要在根和花中表达较高。氧化胁迫分析结果表明,32个基因受ABA、SA、盐、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,很可能参与了番茄逆境胁迫...

• 单位
  广东省农业科学院; 暨南大学