基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的克柔念珠菌遗传分化研究

作者：龚杰; 张沈茜; 张慧芳; 肖盟; 何利华; 赵飞; 徐英春; 张建中; 肖迪

来源：疾病监测, 2019, (11): 969-973.

• 克柔念珠菌
• 谱系
• 遗传分化
• 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
• 分类模型 Candida krusei
• Lineage
• Genetic differentiation
• Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry
• Classification model

目的在蛋白质水平明确克柔念珠菌的遗传分化特征,建立基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)的不同谱系克柔念珠菌的鉴定方法。方法选取20株克柔念珠菌,采用MALDI-TOF MS结合分析软件ClinProTools,确定克柔念珠菌不同谱系的质谱标志峰,构建基于遗传算法(GA)的分类模型,用于区分不同谱系的克柔念珠菌菌株,选择25株克柔念珠菌对该模型进行验证。结果利用20株克柔念珠菌构建的GA分类模型,反映模型正确鉴别能力的识别能力值(RC)为100%,反映模型处理测试谱图变异能力的交叉验证值(CV)为97.89%。25株克柔念珠菌、150张谱图外部验证模型显示其分类能力为...

• 单位
  中国医学科学院/北京协和医院; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 北京市; 北京大学