基于特征筛选方法预测不同离子通道活性的芋螺毒素

作者：袁鲁峰; 丁辰; 郭守辉; 陈伟; 林昊

来源：生物数学学报, 2013, (04): 709-715.

• 离子通道活性芋螺毒素
• 支持向量机
• 二项式分布
• 二肽 Ion channel-targeted conotoxins
• Support vector machine
• Binomial distribution
• Dipeptide

芋螺毒素是一种具有丰富序列多样性且富含二硫键的多肽.因其能够特异性地结合离子通道,阻断神经冲动的传递,芋螺毒素又具有极大的潜在药用价值.面对庞大的芋螺毒素种类,需借助理论的手段和方法来进行研究,从而降低实验成本,为实验做出理论指导.本文基于二项式分布结合支持向量机算法对芋螺毒素离子通道活性类型进行了预测,jackknife交叉验证的总体精度和平均精度分别达到87.5%和86.8%.结果表明,本文所建模型能够用于芋螺毒素的离子通道活性预测,为基于芋螺毒素新药物的进一步开发提供帮助和理论依据.

• 单位
  电子科技大学