杜仲BR受体蛋白基因EuBRI1克隆及生物信息学分析

Authors：刘明月; 赵懿琛; 赵德刚

Source：基因组学与应用生物学, 2018, (04): 1582-1588.

DOI：10.13417/j.gab.037.001582

• 杜仲
• EuBRI1
• 基因克隆
• 生物信息学分析 Eucommia ulmoides
• Gene cloning
• Bioinformatics analysis

为解析杜仲BR相关基因功能,本研究通过前期构建的杜仲转录组数据库注释的信息,获得BRI1同源序列。设计特异性引物,以杜仲基因组DNA及c DNA为模板进行PCR扩增克隆得到3 612 bp cDNA序列,命名为EuBRI1。序列分析发现EuBRI1是一个无内含子的完整开放阅读框,编码1 203个氨基酸的蛋白。分析表明,EuBRI1为稳定亲水性蛋白,相对分子质量为131.361 kD;理论等电点p I为6.31;对其二级结构分析显示α-螺旋占31.50%,无规卷曲占55.94%,延伸链占12.55%,EuBRI1含信号肽序列和跨膜结构以及BRI1家族激酶的保守结构域。进化树分析表明,EuBRI1...

• Institution
  贵州省农业科学院; 生命科学学院; 贵州大学