和牛及其杂交牛瘤胃细菌多样性分析

作者：张智慧; 李伟; 韩永胜; 赵金波; 宋雪莹; 郭春晖

来源：黑龙江畜牧兽医, 2019, (23): 44-49.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2019.01.0086

• 和牛
• 杂交和牛
• 高通量测序
• 瘤胃细菌
• 菌群结构
• 多样性 Wagyu
• crossbreed Wagyu
• high throughput sequencing
• rumen bacteria
• bacterial community
• diversity

为了揭示纯种和牛及杂交和牛瘤胃细菌组成及多样性,选取安装有永久性瘤胃瘘管的年龄、体重和体况接近的纯种和牛公牛(WW)、和牛♂×西门塔尔牛♀杂交F1代公牛(WS)及和牛♂×荷斯坦牛♀杂交F1代公牛(WH)各3头,采集试验牛瘤胃液,提取细菌DNA,对细菌16S rDNA V4～V5区(515F～907R)进行PCR扩增,扩增产物用Illumina HiSeq PE250测序平台进行高通量测序。结果表明:9个瘤胃液样本共获得604 174条有效16S rDNA序列,19 912个分类操作单元(OTU),物种丰富度指数(Chao指数)WW组极显著高于WH组(P<0.01),WS组显著高于WH组(P<0...

• 单位
  黑龙江省农业科学院