人肝细胞癌细胞DNA甲基化谱的检测及分析

作者：孙宁; 张佳林; 张城硕; 周翔宇; 陈保民

来源：中国医科大学学报, 2017, 46(12): 1111-1116.

DOI：10.12007/j.issn.0258-4646.2017.12.012

• 肝细胞癌
• 甲基化谱
• 生物信息学分析

目的 检测人肝细胞癌细胞的DNA甲基化谱,明确肝细胞癌细胞中差异甲基化位点和基因的表达分布情况,进一步探讨DNA异常甲基化与肝细胞癌发生发展的关系.方法 使用DNA甲基化芯片(Infinium Human Methylation 450K BeadChip)检测人肝细胞癌细胞Huh7和人永生化肝细胞L02的甲基化谱,并对检测结果进行生物学分析.结果 共检测到差异性甲基化位点102 254个,差异性甲基化基因26 511个,甲基化相关信号通路43个,其中57.3％的高甲基化CpG位点和39.4％的低甲基化CpG位点的甲基化差异程度≥50％,筛选后确定了3 222个显著高甲基化基因和2 204个显著低甲基化基因.结论 在Huh7和L02细胞中存在大量差异性甲基化CpG位点及基因,Huh7细胞中可检测到大量抑癌基因DNA的异常高甲基化,提示DNA异常甲基化与肝细胞癌的发生发展密切相关.

• 单位
  中国医科大学附属第一医院