《正谊堂全书》与鳌峰书院息息相关,一方面《正谊堂全书》的编刻,是由鳌峰书院建立者张伯行、书院山长蔡璧及诸同人共同努力的结果;另一方面,《正谊堂全书》刊布之后,作为鳌峰书院的学约、教材及藏书,发挥了多种功能,前后影响这所书院不下一百年之久。两者的结缘不仅表明书院功能的多样性,更展现出书院与理学一体化的深度;作为宋明以至清初程朱理学的总结性丛书,《正谊堂全书》也在当时由王返朱的理学思潮中发挥了重要的作用。