高糖土壤微生物宏基因组文库的构建及β-葡萄糖苷酶基因鉴定

作者：陆坚; 杜丽琴; 庞浩; 马贵; 韦宇拓; 黄日波

来源：基因组学与应用生物学, 2013, (01): 30-35.

• 高糖土壤
• 未培养微生物
• 宏基因组文库
• &beta
• -葡萄糖苷酶 Sugar enriching soil
• Uncultured microorganism
• Metagenome DNA library
• &beta
• -glucosidase

采用宏基因组技术构建了高糖土壤微生物的DNA文库,该文库约含9万个克隆,文库外源DNA总容量为3.1×10~9bp。利用活性筛选策略,对文库进行筛选,获得11个β-葡萄糖苷酶的阳性克隆,并对其中2个表达β-葡萄糖苷酶的克隆进行亚克隆和序列分析,获得两个编码新型β-葡萄糖苷酶的基因分别命名为:unbgl3A和unbgl3B。生物信息学分析表明:unbgl3A基因由2241个碱基对组成,unbgl3B基因由2292个碱基对组成。在核苷酸水平上,unbgl3A、unbgl3B与已知数据库中的β-葡萄糖苷酶基因没有任何相似性。在氨基酸水平上,与GenBank数据库中已知β-葡萄糖苷酶的相似性分别为73%和69%。

• 单位
  广西大学; 广西科学院