牛α_(s2)酪蛋白、κ酪蛋白基因启动子区多态性研究

摘要

为研究牛CSN1S2、CSN3基因启动子多态性。选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,设计特异性引物分别扩增2个牛种CSN1S2、CSN3基因5’调控区及第1外显子部分序列。结果表明:CSN1S2基因5’调控区存在3个SNPs位点:A-253T、A-317G、A-407G,CSN3基因5’调控区发现4个SNPs:T-79G、G-415G、T-421C、T-658G,2个牛品种在不同位点的多态性有显著差异。生物信息学软件预测CSN1S2、CSN3基因核心启动子区及转录因子结合位点,CSN1S2基因A-253T、A-317G位于预测核心启动子区。SNP位点造成CSN3基因7个转录因子结合位点消失,而产生10个新的转录因子结合位点。对于CSN1S2、CSN3基因,突变前后RNA二级结构有明显改变,目标序列均未发现CpG岛。研究结果为进一步确定其启动子功能奠定试验基础。

关键词