苯甲酸及其类似物与酪氨酸酶分子对接研究

摘要

以Auto Dock 4.2和i GEMDOCK 2.1分子对接软件对13种苯甲酸类似物与酪氨酸酶进行模拟对接研究,探讨苯甲酸类似物对接结合自由能与实验测得的酶抑制活性的关系,并对分子对接结果进行分析。结果表明:Auto Dock 4.2程序中Cu电荷数的设置对结合自由能有显著影响,铜电荷数为2.0时,苯甲酸类似物结合自由能和p IC50(-lg IC50)线性相关系数可达0.803 6。i GEMDOCK 2.1预测苯甲酸类似物的结果线性较差,即Auto Dock 4.2较i GEMDOCK 2.1预测酪氨酸酶抑制剂的可靠性更高。

关键词