铁皮石斛Ty1-copia类反转录转座子反转录酶(RT)序列的克隆与分析

作者：李聪; 斯金平; 高燕会; 朱玉球

来源：中国中药杂志, 2014, (02): 209-215.

• 铁皮石斛
• Ty1-copia类反转录转座子
• 反转录酶(RT)
• 异质性

该研究根据Ty1-copia类反转录转座子RT的通用引物,从铁皮石斛浙江临安(C15)和云南广南(A39)种质中扩增得到43条Ty1-copia类反转录转座子RT序列,这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为,序列长度变化范围260~266 bp,终止密码子和移码突变,所有序列均富含碱基AT,一致性为47.1%~97.7%。经plantCARE软件分析发现受低温、热、光、各种植物生长调节物质等不同胁迫条件作用的调控元件、多个启动子的特征结构TATA box和CAAT box的保守序列及其他一些调控元件。翻译成氨基酸后,有10条序列出现1~4个不同程度的终止密码子突变,5条序列出现移码突变,保守序列"SLYGKQ"发生变异的有39条序列。其氨基酸序列经过系统聚类后可分为6类;且与其他植物(尤其是单子叶植物的小麦、荸荠)具有较高的同源性,表明它们间可能存在着Ty1-copia反转录转座子的横向传递。

• 单位
  浙江农林大学