拷贝数变异全基因组关联鉴定猪骨率性状候选基因

作者：王立刚; 张跃博; 颜华; 张龙超; 侯欣华; 刘欣; 王立贤

来源：畜牧兽医学报, 2019, (11): 2208-2214.

• 拷贝数变异
• 骨率
• 全基因组关联
• 猪 copy number variation
• bone rate
• genome-wide association
• swine

旨在挖掘影响猪骨率性状的全基因组范围内的拷贝数变异(copy number variations, CNVs),并对其所覆盖的基因的作用模式及机理进行研究。本研究利用基于测序深度的CNVcaller软件对大白×民猪F2群体的拷贝数变异进行检测,利用TASSEL软件中的混合线性模型(mixed-linear model, MLM)对骨率性状进行基因组关联分析;查找数据库对CNVs所覆盖基因进行深入分析,利用RNA重测序对75日龄大白猪腿软骨中4个显著CNVs的表达进行检测。结果表明,在F2代群体中,共检测到3 027个CNVs,其中,共有1 251个为缺失,987个为多拷贝,789个为缺失和多拷...

• 单位
  中国农业科学院