利用生物信息学分析鉴定鼻咽癌转移的信号通路及核心基因

作者：宫伟; 李涛

来源：中国医药生物技术, 2019, (06): 487-493.

• 鼻咽肿瘤
• GEO数据库
• 肿瘤转移 Nasopharyngeal neoplasms
• GEO data
• Neoplasm metastasis

目的利用基因芯片技术和生物信息学分析方法,筛选出鼻咽癌转移相关的核心基因和相关信号通路,为寻找鼻咽癌转移早期诊断和靶向治疗潜在标志物提供依据。方法 GSE103611的表达芯片从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载,该数据库中包含48个样本,包括24个原发鼻咽癌样本和24个放疗后转移的鼻咽癌样本。整理微阵列数据集获得差异表达基因(DEGs)与本课题组前期构建的相对于CNE-2侵袭转移能力更强的CNE-2SI细胞对比芯片差异基因进行比对获得共同差异基因。利用基因本体论(GO)和京都百科全书基因和基因组数据库(KEGG)对共同差异基因进行富集并利用DAVIDE在线进...