非特指型外周T细胞淋巴瘤基因芯片表达谱GEO数据库挖掘分析

作者：李喆; 谭晓虹; 王明月; 孙洁; 柯晴; 岑洪

来源：Chinese Journal of Cancer Prevention and Treatment, 2019, (19): 1455-1461.

DOI：10.16073/j.cnki.cjcpt.2019.19.09

• 外周T细胞淋巴瘤-非特指型
• 差异基因
• 信号通路
• 基因数据库
• 基因芯片表达谱 PTCL-NOS
• differential gene
• signal pathway
• gene database
• microarray expression profiling

目的由于低发生率和异质性,非特指型外周T细胞淋巴瘤(PTCL-not otherwise specified,PTCL-NOS)在生物活动过程中很多方面仍然是未知的。本研究基于基因芯片数据采用生物信息学方法,挖掘PTCL-NOS的差异基因和相关信号通路,为进一步研究提供线索。方法从基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据库获得2个数据集(GSE6338、GSE58445),采用基因本体论对差异基因进行功能分析。通过蛋白互作网络构建关键基因功能模块,进行京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG...

• 单位
  广西医科大学附属肿瘤医院