RT-PCR Detection and Sequence Analysis of Apple Chlorotic Leaf Spot Virus (ACLSV) Infecting Apple in Yunnan

作者：姬盼; 王连春; 孔宝华; 李晓鹏; 曹克强; 马钧

来源：云南农业大学学报, 2013, 28(4).

DOI：10.3969/j.issn.1004-390X(n).2013.04.002

• Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV)
• RT-PCR
• CP
• clone
• sequence analysis

以云南昭通、昆明、曲靖等地采集的苹果病毒病样品为试材,对其是否携带苹果褪绿叶斑病毒(ACLSV)进行RT-PCR检测,将本试验获得3个云南ACLSV分离物(ZT,ML,TJX)和GenBank上已登录的24个分离物进行序列比对分析.所有的ACLSV分离物的核苷酸序列相似性为81.3％～ 99.7％,它们可以被分成两大组群,组群A,包括了大部分不同寄主、地理来源的分离物,所有的ACLSV苹果分离物位于组A；组群B,包括了ACLSV全部的寄主为桃的分离物.本研究获得的3个苹果云南分离物属于组群A,组群A可分成两个亚组,其中,分离物ML和TJX位于同一个亚组,而分离物ZT位于另一个亚组.结果表明ACLSV苹果分离物与寄主种类存在一定的相关性,该研究为株系划分、分子流行和寄主抗性分析提供依据.

• 单位
  云南农业大学