RNA-Seq分析baeSR和acrB对鼠伤寒沙门菌相关毒力基因表达的影响

作者：李锐; 高海侠; 徐军; 王瑞; 王文静; 张瑞良; 赵霞; 李琳

来源：畜牧兽医学报, 2019, 50(11): 2318-2325.

DOI：10.11843/j.issn.0366-6964.2019.11.016

• 鼠伤寒沙门菌
• RNA-Seq
• baeSR
• acrB
• 荧光定量PCR Salmonella typhimurium
• real-time PCR

本研究旨在探索baeSR和acrB基因缺失后对鼠伤寒沙门菌相关毒力基因表达的影响。采用RNA-Seq技术筛选鼠伤寒沙门菌体外诱导环丙沙星耐药株(CR)、acrB基因缺失株(CRΔacrB)、baeSR和acrB基因双缺失株(CRΔbaeSRΔacrB)的差异表达基因,对筛选的基因进行GO富集和KEGG通路富集分析,进一步探究差异表达基因的主要功能及涉及的生物过程,并选出7个差异显著基因进行荧光定量PCR验证。结果表明CRΔacrB与CR相比较,共筛选到1 320个差异表达基因(fold change的绝对值>2,Q-value<0.005),其中上调426个,下调894个;CRΔbaeSRΔa...

• 单位
  安徽农业大学