百日草几丁质酶基因片段克隆及其序列分析

作者：张振鲁; 张佳诗; 隋丽; 李启云; 王金刚; 盛岩; 杜茜; 汪洋洲

来源：安徽农业科学, 2013, (25): 10256.

• 百日草
• 几丁质酶基因
• 克隆
• 序列分析 Zinnia elegans
• Chitinase gene
• Clone
• Sequence analysis

[目的]克隆百日草几丁质酶的基因片段,并对其序列进行分析。[方法]以百日草"梦境"系列为材料,提取其叶片总RNA,并根据其他植物几丁质酶基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR克隆百日草几丁质酶基因片段(ZEchi),并对该基因序列进行分析。[结果]克隆得到的片段长度为227 bp,共编码75个氨基酸残基;核苷酸同源性分析表明,ZEchi与已报道的其他植物几丁质酶基因同源性达70%以上,其中与葡萄的同源性最高,为74%;氨基酸同源性分析表明,该几丁质酶多肽属于18家族几丁质酶,且与已报道的其他植物几丁质酶氨基酸序列具有70%以上的相似性;氨基酸聚类分析表明,该几丁质酶多肽与白车轴草和蒺藜苜蓿的几丁质酶聚类;生物信息学分析表明,由该基因片段编码的多肽为非跨膜蛋白,主要含α螺旋和随机线圈螺旋等二级结构。[结论]该研究为进一步研究几丁质酶基因的功能奠定了基础。

• 单位
  中国人民大学; 东北农业大学; 吉林省农业科学院