云南省家鼠疫源地鼠疫耶尔森氏菌分子流行病学特征研究

作者：石丽媛; 谭红丽; 郭英; 董珊珊; 丁奕博; 张海鹏; 段存娟; 钟佑宏; 李伟; 王鹏

来源：中国病原生物学杂志, 2019, (10): 1125-1129+1134.

DOI：10.13350/j.cjpb.191003

• 鼠疫
• 云南
• 家鼠
• 多位点可变数目串联重复序列分析 Plague
• Yunnan
• Rattus flavipectus
• multiple-locus variable-number tandem repeat analysis

目的探讨云南家鼠疫源地鼠疫菌在云南鼠疫菌遗传进化上所处的位置,及其种群流行演化规律。方法按照不同地点、时间及分离源随机选取186株家鼠疫源地鼠疫菌,采用差异区段(DFR)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPRs)及多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)3种方法进行分子分型分析;以DFR+CRISPRs双重方法聚类分析划分基因簇,以MLVA26对基因簇再次聚类分析划分亚簇。结果 186株家鼠疫源地鼠疫菌中的184株聚为一个簇(家鼠鼠疫簇),其余2株为独立株;近史流行期、复燃流行期和2016年疫情分离株分别处于不同的亚簇,它们之间的位点差异至少有5个;复燃流行期菌株共有5个亚簇和6个独立...

• 单位
  云南省地方病防治所; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所