高通量DNA甲基化数据的处理和分析方法

Authors：王心宇; 许颖出; 刘洪波; 王芳; 张岩; 苏建忠

Source：生物信息学, 2014, 12(1): 72-76.

DOI：10.3969/j.issn.1672-5565.2014.01.12

• DNA甲基化
• 高通量
• 二代测序
• BS-Seq

DNA甲基化作为一种表观遗传学修饰,在调控基因表达、X染色体失活、印记基因等方面都发挥着重要的作用.不同的DNA甲基化的预处理方法结合二代测序产生了大量的高通量甲基化数据,这些数据的存储、处理和分析是当前亟需解决的问题.在本文中,总结了目前存在的三种高通量DNA甲基化检测技术(限制性内切酶法,亲和纯化法,重亚硫酸盐转换法),以及针对这些技术产生的高通量数据开发的存储、处理和分析工具.另外,还注重介绍了单碱基水平的DNA甲基化检测技术,BS-Seq的测序原理、数据处理流程以及后续的分析工具.

• Institution
  哈尔滨医科大学