质粒DNA中宿主菌基因组DNA残留检测方法的比较

摘要

目的对检测质粒DNA中宿主菌基因组DNA含量的Southern blot和Real-time PCR法进行比较。方法PCR扩增宿主菌染色体DNA的16SrRNA片段,以地高辛标记回收的目的片段为探针,对提取的质粒pcDNAH进行Southern blot,同时根据16SrRNA基因序列设计探针,建立Real-time PCR反应体系和标准曲线,分别检测质粒中宿主菌基因组DNA的含量。结果应用Southern blot和Real-time PCR检测质粒pcDNAH中宿主菌基因组DNA的含量,结果均符合WHO相关标准。结论两种检测方法各有优缺点,均可用于检测质粒DNA中宿主菌基因组DNA的残留,可根据不同情况,采用不同方法或配套使用。

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