2型猪链球菌葡萄糖胺-6-磷酸脱氨酶的生物信息学分析

作者：钱思彤; 王一男; 龚秀芳; 丁晨曦; 胡丹; 艾乐乐; 王长军

来源：中国病原生物学杂志, 2019, (10): 1160-1165+1170.

DOI：10.13350/j.cjpb.191009

• 2型猪链球菌
• 葡萄糖胺-6-磷酸脱氨酶
• 生物信息学 Streptococcus suis serotype 2
• glucosamine-6-phosphate deaminase
• bioinformatics

目的利用生物信息学方法分析预测2型猪链球菌葡萄糖胺-6-磷酸脱氨酶(Glucosamine 6-phosphate deaminase,NagB)的性质、结构与功能等信息。方法利用DNAStar、ProtParam、PredictProtein、PSORT、SignalP、TMHMM、SOMPA、PROSITE、SWISS-MODEL、SYBYL-X和ClustalX等在线分析软件对2型猪链球菌中的NagB理化性质、亚细胞定位、二级结构、三级结构及活性中心等进行分析。结果 NagB由378个氨基酸残基构成,无信号肽及跨膜区,是稳定的亲水性胞浆蛋白。二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主分别占46.3...