7株广西鸭源NDV分离株全基因序列测定及遗传进化分析

作者：陈安莉; 谢芝勋; 刘加波; 庞耀珊; 邓显文; 谢志勤; 谢丽基; 范晴

来源：中国兽医学报, 2013, (09): 1323-1328.

• 新城疫病毒
• 全基因组
• 测定与分析 Newcastle disease virus
• genome
• sequencing and analysis

根据GenBank公布的B1毒株(AF375823.1)全基因组序列,使用软件Primer Premier 5.0进行引物设计及引用已发表引物,经过筛选,最终用于扩增鸭源新城疫病毒(NDV)全基因组序列的引物为15对,运用RT-PCR方法获取了7株鸭源NDV毒株结果表明7株鸭源NDV毒株GX16/2008、GX17/2009、GX18/2009、GX19/2009、GX20/2010、GX21/2010和GX22/2010的全基因组序列,并对其进行了比较分析。此7株病毒的全基因组序列均由15 186个碱基组成,GenBank登录号为JX193077-JX193083。F蛋白裂解位点的氨基酸序列表明所有的分离株都是无致病性的序列。7分离株中5株氨基酸顺序为112 G-K-Q-G-R-L117,2株为112 G-R-Q-G-R-L117,绘制的进化树分析表明其中5株属于NDVs基因Ⅰ型,2株属于基因Ⅱ型。它们在全基因组核苷酸和氨基酸水平上,发现与HM125898WDK/JX株相似性较接近,而与F48E8、Mukteswar等毒株的同源性较低。

• 单位
  广西壮族自治区兽医研究所; 广西大学