DNA条形码序列对不同品种美国山核桃的鉴定

Authors：陈亚辉; 朱海军; 生静雅; 张普娟; 鲍瑾; 刘广勤

Source：江苏农业学报, 2013, 29(06): 1445-1450.

• DNA条形码
• 美国山核桃
• 品种鉴定

选择ITS、ITS2、psbA-trnH、matK 4条序列进行评价,以扩增及测序成功率、变异位点数和k-2-p距离等指标评价各序列的鉴定能力。此外,基于MEGA5分析不同品种美国山核桃序列种间K2P遗传距离并构建NJ树。结果显示:不同品种美国山核桃4条序列的扩增及测序成功率扩增均为100%。不同品种的ITS2和psbA-trnH序列一致性为100%,而ITS和matK序列的一致性分别为99.32%和99.95%,两者均存在较多的变异位点,可以有效地区分美国山核桃不同品种。因此,ITS和matK序列可以作为鉴定美国山核桃不同品种的优势条形码组合。

• Institution
  江苏省农业科学院