化学诱导后白木香转录组文库的构建与测序

作者：吴宏清; 王磊; 陶美华; 高晓霞; 白玲; 章卫民

来源：生物技术通报, 2013, (08): 63-67.

• 白木香
• 化学诱导
• 转录组文库
• 测序
• 组装
• Unigenes Aquilaria sinensis Chemical induction Transcriptome library Sequencing Assembly Unigenes

采用改良异硫氰酸胍-CTAB法对5年生白木香树干经化学诱导后1年的各部分组织进行总RNA提取,提取到的总RNA经富集mRNA、打断、构建测序用cDNA文库后用于转录组测序,测序质量较高,Q20高达97.45%,共获得54 685 634条Clean reads,总测序长度达4 921 707 060 nt,经初步组装,获得190 109条Contigs序列,进一步组装,获得83 467条Unigenes序列,总长度为58 569 625 nt,平均长度为702 nt,N50值高达1 120,大于等于3 000 nt的Unigenes有1 691条,占总Unigenes的2.03%,组装质量较高...

• 单位
  广东省微生物研究所; 广东药学院; 江西农业大学