荔枝抗坏血酸过氧化物酶cDNA的克隆和分析

作者：赖建勋; 金志强; 王家保

来源：安徽农业科学, 2007, (26): 8164-8167.

DOI：10.3969/j.issn.0517-6611.2007.26.034

• 荔枝果皮
• 抗坏血酸过氧化物酶基因
• 克隆
• 分析

[目的]为了对荔枝果皮中克隆的APX基因进行cDNA序列分析.[方法]采用RT-PCR和RACE技术从荔枝果皮中扩增克隆抗坏血酸过氧化物酶基因.利用NCBI的ORF Finder程序分析克隆基因的序列,然后将ORF转换成氨基酸序列,进行BLASTX和BLASTN分析,最后用dnasis max2.6pro软件将荔枝与胡瓜、加杨等8种植物进行APX氨基酸序列配比和进化树分析.[结果]该基因cDNA全长1 118 bp,含有645 bp的ORF,编码214个氨基酸.它编码的氨基酸序列与胡瓜、加杨、龙眼、落花生、豌豆、芸苔、帕拉港橡胶树和紫花苜蓿编码的氨基酸序列的同源性分别为83 %、89 %、97 %、78 %、84 %、75 %、79 %和85 %.推测该蛋白的分子式为C1946H3249N645O827S142,相对分子质量为53 466.5,等电点为5.16,理论推导半衰期大于10 h.[结论]该基因的克隆与cDNA序列分析为采后荔枝果皮中抗坏血酸过氧化物酶的基因工程操作奠定了基础. 因cDNA全长1 118 bp,含有645 bp的ORF,编码214个氨基酸.它编码的氨基酸序列与胡瓜、加杨、龙眼、落花生、 豆、芸苔、帕拉港橡胶树和紫花苜蓿编码的氨基酸序列的同源性分别为83 %、89 %、97 %、78 %、84 %、75 %、79 %和85 %.推测该蛋白的分子式为C1946H3249N645O827S142,相对分子质量为53 466.5,等电点为5.16,理论推导半衰期大于10 h.[结论]该基因的克隆与cDNA序列分析为采后荔枝果皮中抗坏血酸过氧化物酶的基因工程操作奠定了基础. 因cDNA