牙鲆MHC-DAA结构及其等位基因多态性

Authors：徐田军; 陈松林

Source：遗传, 2009, 31(10).

DOI：10.3724/SP.J.1005.2009.01020

• 牙鲆
• DAA基因结构
• 等位基因
• 多态性

为了探讨牙鲆MHC-DAA等位基因的多态性,根据牙鲆(Paralichthys olivaceus)MHC-DAA的cDNA序列设计特异引物,扩增内合子序列.牙鲆DAA基因由4个外显子和3个内含子组成,与大西洋鲑(Salmo salar)DAA基因结构相同,在内含子2中存在一个高度多态的微卫星位点(GT)n.根据获得的MHC-DAA基因组序列设计特异性引物,在45尾牙鲆中扩增了包括完整外显子2和内含子2的长度约670 bp的DNA片段,克隆测序后共发现30个MHC-DAA等位基因,各等位基因的频次及其各主型中亚型的数目都不均衡.在249 bp的外显子2序列中共有55个位点发生变异,核苷酸多样性指数为0.0887,编码的氨基酸序列中多态变异位点31个,其中简约信息位点30个,单变异位点1个.非同义替代与同义替代的比率在PBR(Peptide binding region)和非PBR结合区分别为3.30和2.43,分析证明平衡选择是牙鲆存在众多DAA等位基因的发生机制.

• Institution
  浙江海洋学院; 中国水产科学研究院黄海水产研究所