利用ITS1和ITS4通用引物扩增香蕉枯萎病菌核酸片段鉴定其生理小种

作者：曹永军; 程萍; 喻国辉; 黎永坚; 杨紫红; 周林

来源：热带作物学报, 2010, (07): 1098-1102.

• 香蕉枯萎病菌
• rDNA-ITS
• 系统发育分析 Fusarium oxysporum f.sp.cubense(Foc)
• rDNA-ITS
• Phylogenetic analysis

利用真菌核糖体rDNA区通用引物ITS1和ITS4,扩增采集自香蕉的13株镰刀菌包括18S rDNA部分序列、ITS1-5.8S-ITS2全部序列和28S rDNA部分序列的片段,通过BLAST序列比对分析,确定13株菌为尖孢镰刀菌[Fusarium oxysporum]。采用最大简约法,以层出镰刀菌[F.proliferatum(EU151490)]和茄病镰刀菌[F.solani(GQ376116)]为外群,将13株菌的序列与BLAST检索获得的尖镰孢古巴专化型(F.oxysporum f.sp.Cubense)相应序列构建了系统发育树。系统发育分析结果显示,13株菌与NCBI登录的4个尖镰...

• 单位
  华南农业大学; 珠海市农业科学研究中心; 华中农业大学生命科学技术学院