华南地区猪流行性腹泻病毒的分子流行病学调查与分析

作者：王栓群; 孙瑞芹; 刘燕玲; 夏平安; 宋长绪

来源：广东农业科学, 2015, (06): 97-104.

• 猪流行性腹泻病毒
• 分子流行病学
• 基因进化分析 porcine epidemic diarrhea virus
• molecular epidemiology
• gene evolution analysis

为了解华南地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行、变异及进化情况,从该地区的不同猪场采集2 159份样品,利用RT-PCR方法检测PEDV,扩增了部分PEDV阳性样品中的S、M和ORF3基因并测序,利用生物信息学软件进行序列分析。结果显示,PEDV在猪场中的检出率为100%,在所有样品中的平均检出率为53.0%,在哺乳仔猪、断奶仔猪、育肥猪和母猪样品中,PEDV平均阳性率分别为67.6%、42.8%、12.8%和47.2%。根据S、ORF3和M基因建立的进化树,PEDV可分为2个基因群,其中当前样品株为一群,韩国、美国和中国的参考毒株为一群。结果表明,PEDV在华南地区猪场普遍存在,其基因也在...

• 单位
  河南农业大学; 广东省农业科学院