利用生物信息学和qRT-PCR分析鉴定水稻细菌性条斑病QTL qBlsr5a的候选基因

作者：谢小芳; 林德塨; 许国泉; 李春兰; 陈志伟; 吴为人

来源：分子植物育种, 2013, (03): 293-298.

• 细菌性条斑病
• qBlsr5a
• 候选基因
• 生物信息学
• qRT-PCR Bacterial leaf streak
• qBlsr5a
• Candidate gene
• Bioinformatics
• qRT-PCR

细菌性条斑病(简称细条病)是水稻的主要病害之一。前期研究已将细条病抗性QTL qBlsr5a精细定位在5号染色体上一个大约300kb的区间内。为了寻找该QTL的候选基因,本研究利用生物信息学方法对该区间进行分析,筛选出10个与抗病相关的注释基因。然后以感病品种H359及其抗病近等基因系H359-BLSR5A为材料,对细条病菌接种后这10个基因的表达动态进行qRT-PCR分析。结果表明,2个基因在抗、感材料中几乎没有检测到表达产物;7个基因对病原菌侵染没有明显的响应;1个基因(LOC_Os05g-01700)在病原菌侵染后表达量发生变化且在抗、感材料间存在显著差异。因此推测,该基因是qBlsr5a的一个重要的候选基因。

• 单位
  生命科学学院; 福建农林大学