小反刍兽疫病毒全基因组遗传进化分析

作者：王净; 王鹏; 王长顺; 史冠旭

来源：基因组学与应用生物学, 2018, (04): 1393-1396.

DOI：10.13417/j.gab.037.001393

• PPRV
• 全基因组
• 分子进化树
• 最大似然法
• 遗传距离 PPRV
• The whole genome
• Molecular evolution tree
• Maximum likelihood method
• Genetic distance

为了确定中国小反刍兽疫各毒株间的进化关系,本研究从Gen Bank下载世界各国PPRV全基因组序列,以生物信息学方法建立遗传进化树。搜集到13株PPRV全基因组序列,其中中国10株,印度3株,巴基斯坦0株。中国2013~2014年毒株在同一个分支,2014年北京毒株和同年份的其它毒株相比枝条最长,2015年新疆巴州毒株独立成一个小分支。2014~2015年每一个毒株和2013年新疆伊犁毒株相比,遗传距离都最近,最小值为0.001 1。2007~2008年毒株位于另一分支,2007年西藏两毒株间遗传距离为0.000 6。毒株间的遗传关系跟地理位置呈正相关。本研究揭示国内疫情传播路线可以为中国小反...

• 单位
  河北北方学院