罗非鱼微卫星DNA指纹的计算机化鉴定

作者：宋红梅; 白俊杰; 刘宇飞; 李胜杰

来源：渔业现代化, 2008, 35(5): 21-24.

DOI：10.3969/j.issn.1007-9580.2008.05.006

• 罗非鱼
• 种质鉴定
• 计算机化DNA指纹
• 微卫星

在奥利亚、尼罗和橙色莫桑比克3种罗非鱼的微卫星DNA指纹数据库构建基础上,为进一步开展实际生产应用而将其鉴定功能计算机化.在数据库中每种鱼都有其特异的DNA指纹,根据等位基因的有或无,把每个个体的指纹转换成由数字1和0组成的指纹数据,变为计算机可识别的语言,在此基础上,利用Net语言开发了一套应用软件--鱼类种质鉴定软件1.0,根据微卫星标记的共显性遗传原理,采用Nei公式,计算查询个体与相关群体的遗传距离,追溯该个体的可能来源.在实际应用中,只需将测试样品的扩增结果转换成指纹数据,由计算机辅助进行种质鉴定.该软件具有普适性,任何物种的微卫星数据都可导入进行相关的鉴定.

• 单位
  中国水产科学研究院珠江水产研究所