基于高通量测序发掘番木瓜果实成熟相关miRNA

作者：申艳红; 姜涛; 刘璐琪; 石天磊; 赵湾湾; 陈晓静

来源：果树学报, 2019, (11): 1473-1482.

DOI：10.13925/j.cnki.gsxb.20190229

• 番木瓜
• 乙烯
• 小RNA
• 高通量测序
• 果实 Carica papaya L.
• Ethylene
• microRNA
• High-throughput sequencing
• Fruit

【目的】番木瓜是典型的呼吸跃变型果实,外源乙烯处理使番木瓜呼吸跃变提前,促进果实成熟。分离番木瓜果实成熟相关miRNA,为深入了解呼吸跃变型果实的成熟分子机制奠定基础。【方法】利用高通量测序技术对乙烯(ETH)、1-MCP和清水对照(CG)处理的番木瓜果实进行miRNA和转录组高通量测序,然后对测序获得数据进行生物信息学分析,进行miRNA鉴定和靶基因预测,并与转录组测序结果进行关联分析。【结果】乙烯、1-MCP和对照处理分别获得10 734 196、16 486 803和16 067 290条纯净序列,共鉴定出523个miRNA。其中,已知miRNA个数为1-MCP(303)、CG(214)...

• 单位
  河北科技师范学院; 福建农林大学