福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group)CHUP1基因克隆及其生物信息学分析

作者：刘炜婳; 赖钟雄

来源：热带作物学报, 2013, (05): 875-883.

• 福州宦溪野生蕉(Musa spp.
• AB group)
• CHUP1
• 基因克隆
• 内含子分析
• 生物信息学 Musa spp.(AB group) from Huanxi Town in Fuzhou
• CHUP1
• Gene cloning
• Intron analysis
• Bioinformatics

CHUP1(chloroplast unusual positioning 1)参与了叶绿体移动信号转导过程,对植物避免光伤害及提高光合效率方面具有重要作用,并且与植物抗寒性有密切关系。本研究以福州宦溪野生蕉(Musa spp.AB group)叶片为材料,采用同源克隆的方法,分离出CHUP1基因cDNA和DNA序列,GenBank登录号分别为JX123753、JX880084,命名为Mu-CHUP1。Mu-CHUP1 cDNA全长3 232 bp,ORF 2 931 bp,编码976个氨基酸。福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 cDNA序列与小果野蕉(M.acuminata,AA Group)全基因组测序中的CHUP1 cDNA序列的相似性为84.71%;福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 ORF的DNA序列含8个内含子、9个外显子,而小果野蕉全基因组测序中的CHUP1基因组DNA序列则有11个内含子、12个外显子,两者相差较大。生物信息学预测分析表明,Mu-CHUP1磷酸化位点多达62个,并且含有3个保守结构域,可能与其行使多样性的功能有关。

• 单位
  福建农林大学