草菇TPI基因的克隆、结构及其在同核、异核菌株中的表达量

作者：刘朋虎; 邓优锦; 江玉姬; 谢宝贵

来源：福建农林大学学报(自然科学版), 2013, (01): 63-67.

• 草菇
• 磷酸丙糖异构酶
• 可变剪切
• 协同增效作用 Volvariella volvacea
• triosephate isomerase
• alternative splicing
• synergistic gene expression effect

分别从不能出菇的草菇单孢菌株PYd21(基因组测序菌株)和PYd15(重测序菌株)及由PYd21、PYd15配对杂交获得可正常出菇的异核菌株H15-21中克隆测序了磷酸丙糖异构酶(TPI)基因,并对TPI基因的结构及其在3个菌株中的表达量进行了分析.结果表明:PYd21、PYd15中TPI基因的序列完全相同;转录组读段定位、双末端分析结果显示,TPI基因全长1015 bp,开放阅读框序列全长756 bp,编码251个氨基酸,有6个外显子、5个内含子;RNA加工过程中存在两种可变剪切类型和两个可变剪切位点;数字基因表达谱测序的结果表明,PYd21、PYd15和H15-21中TPI基因的表达量(TPM)分别为30.25、36.49、77.17,同时通过实时荧光定量PCR分析3个菌株中TPI基因的表达情况证实了该结果,表明草菇中TPI基因的表达表现出异核体表达的协同增效作用,预示着异核菌株中两种不同细胞核存在相互作用.

• 单位
  福建农林大学