基于调控网络构建的食管鳞状细胞癌放疗抵抗核心miRNA/mRNA鉴定

摘要

目的基于食管鳞状细胞癌肿瘤组织RNA表达情况构建放疗抵抗miRNA-mRNA网络,鉴定并验证放疗抵抗核心miRNA及mRNA。方法癌症基因图谱(TCGA)数据库选取行放疗的食管鳞状细胞癌患者,R语言edgeR包对比获得放疗抵抗组肿瘤组织差异表达mRNA(DE mRNA)和miRNA(DE miRNA)。miRWalk 3. 0预测DE miRNA的靶mRNA,Cytoscape绘制放疗抵抗miRNA-mRNA调控网络。采用MMC法分析获得核心miRNA及mRNA,实时定量PCR在放射抵抗癌细胞中进行验证。结果共获得548个DE mRNA和5个DE miRNA,成功构建放疗抵抗miRNA-mRN...

关键词