LncRNA在缺氧诱导的胃癌细胞中表达谱的变化

作者：王亚芳; 刘理礼; 靳海峰; 张慧; 张宏博; 聂勇战; 吴开春; 樊代明

来源：现代肿瘤医学, 2013, (02): 225-228.

• 长链非编码RNA
• LncRNA芯片
• 胃癌
• 缺氧 long non-coding RNA
• lncRNA microarray
• gastric cancer
• hypoxia

目的:观察长链非编码RNA(lncRNA)在常氧条件下的胃癌细胞及缺氧诱导的胃癌细胞中表达谱的变化。方法:利用lncRNA芯片技术检测常氧条件下的胃癌细胞,缺氧诱导的胃癌细胞中lncRNA表达谱的变异,经对原始数据进行预处理达到均一化后,筛选出差异表达lncRNA,进行分析。结果:与常氧条件下的胃癌细胞相比较,缺氧诱导胃癌细胞中1.5倍以上变化并有显著差异(P<0.05)的lncRNA,确定为差异表达lncRNA。其中在三种胃癌细胞中的变化均在1.5倍以上的共254条,占所有lncRNA的3.6%;大于1.5倍上调的共136条,1.5倍以上降低的共118条;2倍以上上调的共30条;2倍以上降低的共25条;3倍以上升高的共5条;3倍以上降低的共5条。结论:缺氧诱导的胃癌细胞与常氧的胃癌细胞比较,lncRNA表达谱发生显著变化。提示差异性表达的lncRNAs可能参与了缺氧环境下胃癌细胞多种恶性表型的变化。

• 单位
  中国人民解放军第四军医大学; 西京医院