基于GBS技术对梅花鹿、马鹿及其杂交后代基因组SNP特征的分析

作者：董世武; 王天骄; 刘华淼; 王磊; 唐丽昕; 邢秀梅

来源：畜牧兽医学报, 2019, (12): 2422-2430.

• GBS
• 梅花鹿
• 马鹿
• 杂交鹿
• SNP
• 鉴别 GBS
• sika deer
• red deer
• hybrid deer
• identification

旨在利用基因分型测序(genotyping by sequencing,GBS)技术对梅花鹿、马鹿及其杂交后代(F1、F2)基因组的SNP特征进行分析。本试验采用GBS技术对梅花鹿(63个)、马鹿(12个)及其杂交后代(F1代112个,F2代38个,未知类型个体1个)共226个个体的血液基因组DNA进行测序,并利用本实验室前期110只梅花鹿、197只马鹿和1只F1代杂交鹿的测序数据,以梅花鹿全基因组为参考序列进行比对分析。结果,226个个体共产生Clean data 322.683Gb,平均每个样品1 427.802Mb;将所有样本作为一个群体检测SNP变异,共检测出SNP位点23 943 5...

• 单位
  中国农业科学院