癌症中DNA甲基化基因模块筛选

作者：张淑梅; 张彬; 刘军厚; 刘洪波; 苏建忠; 王芳; 张岩

来源：生物信息学, 2014, (3): 189-195.

DOI：10.3969/j.issn.1672-5565.2014.03.07

• 表观遗传修饰
• 肿瘤
• 甲基化
• WGCNA
• 基因模块

肿瘤的发生受遗传学和表观遗传学修饰的共同影响。 DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰，在癌症的发生与发展中起着重大的作用。因此找到癌症的甲基化标记物在癌症的诊断和治疗中具有重大意义。本文利用权重基因共表达网络分析的方法（ WGCNA）筛选出甲基化基因模块，并分析模块向量基因，进行功能注释，最后对基因模块进行功能分析，得到DNA甲基化与肿瘤间的关系。结果显示，这些甲基化异常的基因模块与癌症的发生有着显著的关联。同时还发现某些甲基化异常的基因模块与多种癌症的发生都有着显著的关联。

• 单位
  哈尔滨医科大学