基于线粒体DNA分子标记的东太平洋茎柔鱼群体遗传多样性比较分析

作者：刘连为; 许强华; 陈新军; 闫杰; 余为; 王从军

来源：水产学报, 2013, (11): 1618-1625.

• 茎柔鱼
• 遗传多样性
• 遗传结构
• 细胞色素b基因
• 细胞色素氧化酶Ⅰ基因

为合理开发利用东太平洋茎柔鱼资源,需要准确掌握其种群结构。基于线粒体细胞色素b(Cytb)与细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)2个分子标记对茎柔鱼赤道海域与秘鲁外海2个地理群体的遗传多样性现状进行比较分析。分析认为,基于Cytb基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为7、(0.397±0.079)、(0.001 09±0.000 96)和0.600,秘鲁外海群体单倍型多样性指数仅为(0.282±0.101),明显低于赤道海域群体。基于COⅠ基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为17、(0.787±0.051)、(0.002 90±0.001 38)和1.802。单倍型网络关系图及两两群体间遗传分化系数F st分析结果显示,赤道海域群体与秘鲁外海群体不存在显著的遗传差异(Cytb:F st=0.005 91,P>0.05;COⅠ:F st=0.055 23,P>0.05),2个地理群体可能在赤道海域海流的作用下发生基因交流。单倍型网络关系图、中性检验和核苷酸不配对分析结果均表明,茎柔鱼经历过近期群体扩张事件,发生群体扩张的时间在138 900~167 900年前。

• 单位
  上海海洋大学