基于布谷鸟搜索的带假结RNA二级结构预测

摘要

RNA在细胞中具有重要的结构、功能和调节作用。RNA单链的结构对于其在有机系统中的作用具有决定性影响,因此RNA结构预测成为研究热点。假结是一种重要但是难以预测的RNA结构。以热动力学模型与最小自由能量理论为基础,本文提出了一种称为CSRNA的基于布谷鸟搜索的启发式算法,用以预测带假结RNA二级结构。通过基于已知RNA序列的预测实验,本文比较了CSRNA与几种算法的预测结果,证明CSRNA算法的有用性及有效性。

关键词