广藿香八氢番茄红素脱氢酶PcPDS1基因克隆和序列分析

作者：欧阳蒲月; 沈笑飞; 曾少华; 王瑛; 莫小路

来源：中草药, 2013, (17): 2446-2452.

• 广藿香
• 八氢番茄红素脱氢酶
• PcPDS1基因
• 基因克隆
• 生物信息学分析 Pogostemon cablin(Blanco) Benth
• phytoene desaturase
• PcPDS1 gene
• gene cloning
• bioinformatical analysis

目的为阐明广藿香类胡萝卜素代谢途径,克隆了广藿香Pogostemon cablin八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)基因,并对其进行相关生物信息学分析。方法搜索本课题组建立的广藿香转录组数据库,获得PDS基因全长序列,并设计全长引物进行PCR验证;利用生物信息学软件对PDS基因进行生物信息学分析。结果本研究获得的广藿香PDS基因命名为PcPDS1(GenBank登录号为KC854409),该基因全长1 960个碱基,编码569个氨基酸。基于生物信息软件分析了PcPDS1基因编码蛋白的理化特性。系统进化树分析结果表明,PcPDS1基因与黄龙胆Gentiana l...

• 单位
  中国科学院; 广东食品药品职业学院